马桶容易沾染污物，所以爱干净的人，会经常进行清洁消毒。但在炎热的夏季，只有这样或许还不够，还应随时盖上马桶盖。
中国疾病预防控制中心环境所微生物室刘秀岩告诉记者，因为马桶在设计上自身有回弯，所以人们在平时不用马桶时，没盖上盖也不觉得会有明显的难闻气味。但夏季高温，挥发强，如总是不盖马桶盖，可能会影响到室内的空气质量。
特别要注意的是，在马桶冲水时一定要盖上盖子。因为马桶冲水时会产生瞬间气旋，在空气中留下液态或固态的微粒悬浮物，可滞留长达几小时，并落在墙壁和物品上。现在很多家庭中，如厕、洗漱、淋浴都在卫生间进行，牙刷、漱口杯、毛巾等与马桶共处一室，自然很容易受到细菌污染。因此，必须养成冲水时盖上马桶盖的习惯。此外，如在马桶边放废纸娄，也应该选择有盖的，并及时清倒，以免影响空气质量。
此外，还要注意保持马桶刷和马桶圈的清洁和干燥，不能让其滋生细菌和微生物等，从而轻易成为家庭中的污染源。在使用马桶刷后，应先冲洗再用消毒液浸泡，悬挂晾干。马桶圈也应注意定期清洗消毒，如果是布料等物为材质的，更应该勤洗勤消毒。
