中国社会科学院考古研究所所长刘庆柱认为京杭大运河目前的现状堪忧。
他说，据我现在掌握的资料，我觉得现状堪忧。具体来讲，第一段是现在正在使用着的，从山东到浙江。这一段有些大运河正在使用，还有山东以北已经基本废弃的。大运河继续发挥作用是应该的，但是如何能够保护好原来历史上运河的遗迹，对现在来说至关重要的。比如原来的码头、水坝、水闸，有些地方由于运河的改造，原来运河相关的遗迹，已经不在运河了。如果不尽快保护好这些东西，作为历史上的运河，已经不存在了，保留下来的可能是近代的运河。
像山东以北运河基本不再用的，更需要保护，不要变成房地产的市场。尤其这个地区经济比较发达，运河沿线废弃的地方最后大量的土地被圈占。因此我觉得，现在一方面要加大保护力度，要控制开发力度。还要唤醒运河沿途的干部、群众重视力度。最后一点我觉得也是最重要的，运河作为一个国家重要的文化遗产，我想是一个政府行为，它涉及又不是政府某个部门，既不是国家文物局一家能解决的，也不是建设部或者水电部他们能解决的。我想国务院需要通盘考虑这个问题，协调有关部委共同搞好运河的开发、利用、保护，而且关键是保护。在保护好的前提下进行利用，进行开发。不要因为开发和利用而放弃了保护，要摆正保护和利用的关系，也就是说保护是第一位的。
